Network-based approach for stress-responsive genes identification in plants:

El seminario aborda el uso de redes computacionales para identificar genes que responden al estrés en plantas, un problema clave en la seguridad alimentaria y la sostenibilidad. A través del Instituto de Investigación en Ciencias Ómicas, se estudian cultivos como arroz y caña de azúcar, especies fundamentales en la agricultura colombiana y afectadas por condiciones adversas como la sequía y la salinidad. Para comprender cómo las plantas responden a estos factores, se analiza la expresión génica utilizando datos transcriptómicos y fenotípicos, comparando sus patrones en condiciones normales y de estrés. La metodología se basa en un análisis de redes que permite identificar grupos de genes relacionados entre sí, en lugar de evaluar genes individuales de forma aislada. Se aplican técnicas estadísticas como correlación de Pearson y regresión Lasso para construir redes que reflejan interacciones entre genes y detectar módulos funcionales relevantes en la respuesta al estrés. Esta aproximación proporciona una visión más integrada y estructurada de los mecanismos biológicos que permiten a las plantas adaptarse a entornos hostiles. Los resultados obtenidos en estudios de caso validaron computacionalmente que los genes seleccionados tienen funciones biológicamente significativas en la respuesta al estrés. Esta investigación representa un avance en la identificación de genes clave que podrían fortalecer la resistencia de los cultivos, contribuyendo así a mejorar la producción agrícola y garantizar la seguridad alimentaria.